Государственный археологический музей-заповедник «Костенки» — эталонный памятник верхнего палеолита, беречь, изучать и пропагандировать который призван музей-заповедник. Для исследователей палеолита Костенки — «археологическая Мекка», где работали все самые известные представители этой науки: П. П. Ефименко, П. И. Борисковский, С. Н. Замятнин, А. Н. Рогачев. Здесь сложилась знаменитая «костенковская школа исследований», характеризующаяся широтой поставленных теоретических задач и кропотливым исследованием фактического материала.
Общая площадь музея-заповедника составляет 9 га и представляет собой 25 охранных зон — выделенных участков земли с особым режимом землепользования, на которых находятся костенковские стоянки. Фонды музея насчитывают около 41 тысячи единиц хранения и представляют собой коллекции каменных и костяных орудий, произведений искусства, собранных с разнокультурных и разновременных памятников Костенок.
Самой большой ценностью музея-заповедника является сохраненный на месте нахождения верхний слой стоянки Костенки 11, представленный жилищем из костей мамонта приблизительным возрастом в 20 000 лет. В специально построенном музейном здании на основе подлинных и копийных материалов создана экспозиция, рассказывающая о самом длительном этапе человеческой истории — каменном веке.