Историко-краеведческий музей города Янаул основан в октябре 1977 года, накануне празднования 60-летия Великого Октября, Постановлением бюро РК КПСС и исполкомом районного совета, до этого велась работа по сбору информации и экспонатов для создания народного музея района.
Для музея было выделено одноэтажное кирпичное здание в центре города. В то время музей представлял собой всего один выставочный зал, где выставлялись все экспонаты и иллюстрации, отражающие историю и быт жителей Янаульского района. В 1985 году музей расширился за счет пристройки. В 2010 году переехал в новое помещение.
Имеется три постоянно действующих и один выставочный зал с площадью 100 кв.м. Фонды музея составляют более 12 тысяч единиц хранения.