Управление Россельхознадзора осуществляет эпизоотический контроль по болезням рыб.
Одна из функций Россельхознадзора – это эпизоотическое контроль выловленной рыбы на подконтрольных территориях. Ее чистоту и здоровье контролируют исследованиями, которые проводят в Тверском филиале Федерального государственного бюджетного учреждения «ВНИИЗЖ». Основными показателями безопасности является исследования на инфекционные и инвазионные болезни рыб, такие как: аэромоноз, ботриоцефалез, бранхиомикоз, филометроидоз карповых рыб, воспаление плавательного пузыря карпа. Стоит отметить, что своевременная лабораторная диагностика – один из наиболее эффективных методов продуктивного лечения и профилактики различных заболеваний, в том числе у рыб. В соответствии с планом эпизоотологического мониторинга на 2023 год Управлением Россельхознадзора в Ярославской области произведен отбор 15 проб карповых рыб (густера, синец, язь, плотва, лещ)для исследований на инфекционные и инвазионные болезни рыб (аэромоноз, ботриоцефалез, бранхиомикоз, филометроидоз карповых рыб, воспаление плавательного пузыря карпа),а так же 13 проб на паразитарные болезни рыб. Вылов вышеперечисленных образцов был произведен в Рыбинском, Горьковском и Угличском водохранилищах в весенний и летний период вылова. По результатам исследований подтверждено благополучие по аэромонозу, ботриоцефалезу, бранхиомикозу, филометроидозу карповых рыб и воспалению плавательного пузыря карпа. Но в некоторых образцах были обнаружены следующие возбудители паразитарных заболеваний, такие как дактилогироз, параценогонимоз, диплозооноз, кариофиллез, диплостомоз. Данные заболевания не опасны для человека, но влияют на экологическое состояние водоемов и снижению численности рыбы. Чем выше показатели интенсивности и экстенсивности инвазии, тем более малочисленна субпопуляция рыбы. По данным выявлениям информация направлена организациям, осуществляющим вылов данной рыбы. В Тверской области Управлением Россельхознадзора был произведен отбор 2 проб карповых рыб (окунь, плотва) для исследований на бактериальные и паразитарные болезни рыб (аэромоноз, ботриоцефалез, бранхиомикоз, филометроидоз карповых рыб, воспаление плавательного пузыря карпа). Вылов вышеперечисленных образцов был произведен в Осташковском районе, Верхневолжском водохранилище и озере Селигер в летний период вылова. По результатам исследований подтверждено благополучие по аэромонозу, ботриоцефалезу, бранхиомикозу, филометроидозу карповых рыб и воспалению плавательного пузыря карпа. С целью контроля эпизоотологического состояния водоемов и рыбы Россельхознадзор проводит ежегодные исследования рыбы выловленных в водохранилищах подконтрольных областей.