Штефан Кисслинг начал обучение органной музыке в Лейпциге у профессора Ш.Блайхера. Затем, после занятий с профессором К.Круммахером и Ш.Нуссером сдал итоговый экзамен в Лейпцигской главной церкви св. Николая. Дополнил свое образование многочисленными курсами у ведущих европейских органистов и педагогов: М. Зандера, В. Рюбзама, Х.-О. Эрикссона, Х. Фагиуса. Окончил аспирантуру у профессора Ш. Энгельса.
Штефан Кисслинг выступает как солист на концертах и церковных службах в Лейпцигской церкви св. Фомы, а также с Оркестром Гевандхауза и Хором церкви св. Фомы. Концертировал в Швеции, Финляндии, Литве, Польше, Австрии, Италии, Испании, Франции, Бельгии, Нидерландах, Люксембурге, США, России, Австралии.
С 1999 года – органист и художественный руководитель международного цикла концертов в Монастырской церкви в Котбусе. В 2008 году был органистом в Брауншвайгском кафедральном соборе. Преподает в Лейпциге и Котбусе.
Органист имеет записи на радио и телевидении. В репертуаре исполнителя - произведения эпохи барокко (Бах, Букстехуде, Векманн), а также позднего романтизма и модернизма (Рейнбергер, Карг-Элерт, Дюрюфле, Регер). Штефан Кисслинг неоднократно являлся первым исполнителем произведений современных авторов.
