Игорь Манашеров родился в 1974 году в Ленинграде. Окончил с отличием Санкт-Петербургскую государственную консерваторию им. Н. А. Римского-Корсакова по специальностям «хоровое дирижирование» (класс Татьяны Хитровой) и «оперно-симфоническое дирижирование» (класс Равиля Мартынова). Также обучался на международных дирижерских мастер-курсах Юрия Симонова в Венгрии (2005–2008).