Центр художника Михаила Шемякина тесно сотрудничает с Музеем Востока и его филиалом в городе Майкопе, где тематические выставки проходят с оригинальными работами художников Северного Кавказа.
В 2000 году Шемякин открыл выставочную площадку «Воображаемого музея» (The Museum of the Imagination) в городе Хадсон, штат Нью-Йорк, где организуются экспозиции по темам исследований. В 2002-м году в Санкт-Петербурге создан Фонд художника Михаила Шемякина, впоследствии переименованный в Центр (далее — «Центр») для реализации культурных, выставочных, научных, и социальных программ. В Центре регулярно проходят выставки, вернисажи, конкурсы работ российских и зарубежных художников. Энергичная и насыщенная деятельность Центра во многом способствует выводу российского изобразительного искусства на магистральные направления мирового развития. Являясь филиалом Института философии и психологии творчества, Центр проводит лабораторно-исследовательскую работу, научно-практические конференции и обучающие семинары.
Каждая конференция (семинар) — новый этап в обобщении накопительного опыта, в осмыслении культурологических проблем, стоящих перед художниками и музеями. Важнейшей задачей, которую решает Центр, является поддержка молодых художников, архитекторов, стимулирование новых идей и подходов в искусстве.
В залах Центра прошли такие выставки как: «Шар в искусстве», «Образ смерти в искусстве», «Крик в искусстве», «Монстры. Мифологические персонажи», «Рука в искусстве» многие другие.
Важным дополнением научной экспозиции, является организация в рамках проекта открытого международного конкурса работ современных художников и тематическая выставка оригинальных работ победителей конкурса.
Каждый выставочный проект Центра сопровождается программой концертов, поэтических вечеров, кинофестивалей и обсуждений темы проекта.