Новосибирский медицинский колледж был создан 25.07.2011г. после реорганизации и слияния Новосибирского медицинского колледжа, Новосибирского базового медицинского колледжа и Государственного Новосибирского Областного Фармацевтического Училища распоряжением Правительства Новосибирской области № 332-рп от 25.07.2011 г. Приказ ДИиЗО № 1776 от 30.08.2011г.
Переименован в ГАПОУ НСО «Новосибирский медицинский колледж» распоряжением правительства Новосибирской области № 528-рп от 22.12.2015 г.