Музей Новосибирска открылся 1 марта 2010 года. Городской музей задумывали создать еще в 1943 году — к 50-летию нашего города, но по понятным причинам этого не произошло. Сейчас Музей Новосибирска — это 8 районных филиалов, музеи в парке «Городское Начало» и в доме Г.М. Будагова и Музей Дома документального кино.
Сотрудники Музея Новосибирска активно занимаются просветительской деятельностью, организуют уличные выставки и выставки в переходах метро, оформляют вагон новосибирского поезда-музея, осуществляют культурно-образовательные проекты.
Фонд Музея Новосибирска содержит документы и экспонаты, обширную видеотеку, значительное библиотечное собрание. Основой для формирования фонда стало творчество основоположника российской и мировой космонавтики Юрия Кондратюка.
Партнерами Музея Новосибирска являются организации в сфере образования и культуры, жители города, предоставляющие на выставки или передающие в дар уникальные документы, фотографии, предметы.