В экспозиции «Музей дворянства Спасского уезда» представлены мемориальные и отражающие эпоху предметы, экспонаты известных дворянских семей, связанных с историей Спасского уезда Казанской губернии. Это семьи Лихачевых, Молоствовых, Мусиных-Пушкиных и многих других. В музее можно увидеть предметы из обихода дворянских семей, посмотреть обустройство дворянской усадьбы, осмотреть надворные постройки.
Экспозиция музея «Город на реке» рассказывает о сложной истории на берегах реки, жителей Болгара и его округи. История освоения с древнейших времен поймы левого берега Волги на слиянии с Камой, соединившей Древний Болгар с современной историей, а также отражает историю уездного города Спасска.
Музей Абдуллы Алиша — музейная экспозиция, посвящена жизни и творчеству и воинскому подвигу татарского детского писателя Абдуллы Алиша (1908–1944 гг.).
В музее «Болгарское чаепитие» представлена большая коллекция самоваров из фондов музея-заповедника. В экспозиции показана история зарождения чайной культуры и ее связи с историей региона начиная с эпохи средневековья.
