Музей расположен в здании Гунибской гарнизонной церкви, построенной в 1862 г.
Этнографический раздел музея «Сакля горцев» построен в виде двухэтажного помещения арочной горской архитектуры. Наверху размещались жилые комнаты, а нижний этаж шел под хозяйственные помещения. Посетители увидят старинную деревянную резную мебель, коллекцию медно-чеканной посуды, разнообразную керамику, инструменты ремесленников, сельскохозяйственные орудия труда, ковры, другие предметы быта горцев, национальные костюмы.
Музей хранит подлинные артефакты Кавказской войны: пушечные ядра, кованые гвозди, подковы. Огромную ценность представляет собой личный набор хирургических инструментов, который подарил русский хирург и ученый Николай Пирогов лекарю–самоучке Кебедгаджияву из селения Корода. Основоположник военно-полевой хирургии провел два месяца в селении Салта в 1847 г. и именно там впервые применил эфирный наркоз в полевых условиях.
В 1862 г. для Павла Романова — сына императора Александра II, по рекомендации Пирогова, начали строительство дворца, со стенами двухметровой толщины. Вся мебель, посуда, постельные принадлежности, кареты, прислуга были доставлены в Гуниб в 1867 г. из Петербурга. Музей хранит большой дубовый стол и два зеркала из дворцовой мебели.
Интерес посетителей вызывают палеонтологический и археологический разделы экспозиции. Гунибский краеведческий музей открыт в 2001 г. и является филиалом Национального музея Дагестана им. А. Тахо-Годи. В собрании более 1660 экспонатов.
