Основу музейной коллекцией живописи и графики составляют произведения западноевропейских мастеров XVII–XX века. Ее подарил родному городу коллекционер Иван Арзамасцев, долгое время проживавший в Чехии. В фондах музея хранятся картины ейских художников Г. Котелевца, П. Кузнецова, Д. Митрохина, Б. Тхора, а также Сергея Бондарчука. Их подарила музею жена режиссера, Ирина Скобцева.
В зале музея постоянно проводятся выставки работ местных художников и учащихся ейской школы искусств. Художники, чьи работы представлены в Ейском художественном музее: Абрамова Ирина, Адамов Евгений Анатольевич, Агошка Юрий Викторович, Агошкин Андрей, Антоновы Сергей и Ольга, Балашова Галина, Бахмач Н.А., Бахмач С.А., Варданян Рафик Сергеевич, Власов Владимир Григорьевич, Власов Алексей Владимирович, Глоба Лариса Ивановна, Гудкова Ирина Глебовна, Дедков Валентин Фёдорович, Дмитриева Татьяна Сергеевна, Довбыш Виктория Александровна, Дубровин Александр, Душевская Ольга, Дядькун Татьяна, Ерёмина Наталья Анатольевна, Ермоленко Марина Николаевна, Карагорскова Арина Александровна, Киргизин А., Коноз Алексей Викторович, Коноз Нина Спартаковна, Коротков Юрий Петрович, Короткий Александр Алексеевич, Кофанова Лилиана Владимировна, Кравченко Ирина Викторовна, Круган Александр Максимович, Коростылёв Николай Фёдорович, Лазарев Михаил Анатольевич, Лебедь Андрей Григорьевич, Лукина Татьяна Николаевна, Минасьян Александр, Мощевикина Людмиоа, Муха Наталья Викторовна.
