Партнерские отношения между регионом и Японией эффективно развиваются в течение 15 лет в инновационной медицине, фармации, машиностроении. Налажено сотрудничество с университетом Канадзавы, специалисты которого вместе с Ярославской медицинской академией в 2007 году создали Российский эндоскопический учебный центр. В 2010-2012 годах крупные японские компании «Комацу» и «Такеда» открыли на территории Ярославской области свои производства.